当前位置: 首页 | 科普园地 | SWATH定量技术

SWATH定量技术

2020-03-05 16:24 发布人:系统

SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragmentions)定量技术,将整个质谱扫描质量范围分为若干窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,采集全部子离子信息。该技术无需指定目标肽段,扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选,同时可实现数据回溯。

应用领域:
适用于多生物样本中的蛋白质组非标定量比较,差异蛋白质的发现。

技术优点:
1.相比DDA技术的非标定量结果,定量重现性和准确度更高。
2.定量蛋白质通量高,能同时实现多达3000个蛋白质的定量。

检测仪器:
TripleTOF 5600,TripleTOF 6600

分析流程:
样品经胰酶酶切后,采用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库,之后采用SWATH方法进行质谱数据采集。定量数据采用Skyline,Peakview等软件处理。

 

可选择数据分析:
1.蛋白质/肽段鉴定及定量结果
2.差异蛋白质统计分析
3.蛋白质GO分析及差异蛋白GO富集分析
4.蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析
5.多样品间表达模式聚类分析(适用于样本数≥3的项目)

样品要求:
蛋白提取物:≥50 μg
细胞:≥106
组织:动物组织≥1 mg,植物组织≥10 mg
体液:血清≥5μL,脑脊液≥10μL