基于TMT/iTRAQ标记的蛋白质组定量
发布时间: 2023-03-01 12:56:02
iTRAQ (isobaric tag for relative and absolute quantitation)和TMT(tandem mass tags)是目前应用最广泛的两大类化学标记定量技术，其原理一样，区别在于分别由AB sciex公司和赛默飞世尔科技公司开发销售。简单来说，iTRAQ、TMT技术的原理是依赖于肽段末端不同的同位素标记以区分样品，通过二维色谱有效分离和质谱分析，对标记试剂所携带的报告离子强度进行计算以匹配对应肽段量，整合各定量肽段的信息以得出蛋白整体变化趋势。
样本经过不同处理后提取蛋白质，经过还原、封闭后进行蛋白酶酶切（通常为胰蛋白酶，trypsin），酶切后的肽段混合物分别用不同的iTRAQ/TMT试剂标记，然后将各种iTRAQ/TMT试剂标记的肽段等量混合，最后进行质谱检测及数据分析。
适用于不同样本的蛋白质组定量研究。
1、适用于各种动物植物组织/细胞、微生物、体液样品分析。
2、一次实验同时对多达16个样本进行定量分析。
3、一次实验可获得高通量的定量数据。
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Q Exactive HF |
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Q Exactive HF-X |
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Orbitrap Fusion™ Tribrid™ |
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EOrbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™ |
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FAIMS Orbitrap Exploris 480等 |
分析流程
可选数据分析
1、质谱数据统计分析。
2、蛋白质/肽段鉴定及定量结果。
3、差异蛋白质统计分析。
4、蛋白质Pathway代谢通路分析及差异蛋白的Pathway富集分析。
5、多样品间分类统计、功能富集、聚类分析（适用于样本数≥3的项目）。
| 蛋白提取物：≥100μg |
| 细胞：≥106 |
| 组织：动物组织≥10mg，植物组织：≥100mg |
| 体液：血清/血浆≥5μL，尿液≥500 μL，唾液、脑脊液等体液≥50 μL |
| ★ 注：具体样品需要量根据实验方案有所不同。 |
联系我们
iTRAQ (isobaric tag for relative and absolute quantitation)和TMT(tandem mass tags)是目前应用最广泛的两大类化学标记定量技术，其原理一样，区别在于分别由AB sciex公司和赛默飞世尔科技公司开发销售。简单来说，iTRAQ、TMT技术的原理是依赖于肽段末端不同的同位素标记以区分样品，通过二维色谱有效分离和质谱分析，对标记试剂所携带的报告离子强度进行计算以匹配对应肽段量，整合各定量肽段的信息以得出蛋白整体变化趋势。
样本经过不同处理后提取蛋白质，经过还原、封闭后进行蛋白酶酶切（通常为胰蛋白酶，trypsin），酶切后的肽段混合物分别用不同的iTRAQ/TMT试剂标记，然后将各种iTRAQ/TMT试剂标记的肽段等量混合，最后进行质谱检测及数据分析。
适用于不同样本的蛋白质组定量研究。
1、适用于各种动物植物组织/细胞、微生物、体液样品分析。
2、一次实验同时对多达16个样本进行定量分析。
3、一次实验可获得高通量的定量数据。
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Q Exactive HF |
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Q Exactive HF-X |
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Orbitrap Fusion™ Tribrid™ |
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EOrbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™ |
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FAIMS Orbitrap Exploris 480等 |
分析流程
可选数据分析
1、质谱数据统计分析。
2、蛋白质/肽段鉴定及定量结果。
3、差异蛋白质统计分析。
4、蛋白质Pathway代谢通路分析及差异蛋白的Pathway富集分析。
5、多样品间分类统计、功能富集、聚类分析（适用于样本数≥3的项目）。
| 蛋白提取物：≥100μg |
| 细胞：≥106 |
| 组织：动物组织≥10mg，植物组织：≥100mg |
| 体液：血清/血浆≥5μL，尿液≥500 μL，唾液、脑脊液等体液≥50 μL |
| ★ 注：具体样品需要量根据实验方案有所不同。 |
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